Приключенческий фильм «Дети шпионов» рассказывает об обычной семье из четырех человек, правда двое из них супер шпионы, а еще двое норовят ими стать.
Кармен и ее младший брат Джуни Кортес живут со своими родителями Ингрид и Грегорио, которые, по мнению детей, очень скучные и не интересные. Они даже не подозревают, что их родители работают в Организации Супер Шпионов. Поначалу Ингрид и Грегорио были врагами, заданием которых было уничтожить друг друга. Но сердцу не прикажешь и после того, как полюбили друг друга, они поженились и затем вырастили замечательных деток. Основной заботой Кармен является ее младший брат, с которым ей приходится вечно нянчиться и к которому она, мягко говоря, не очень дружелюбна. Джуни, в свою очередь, очень скрытный мальчик. Его любимым занятием является просмотр телевизионного шоу, которое ведет знаменитый Феган Флуп. Именно его Ингрид и Грегорио Кортес подозревают в причастности к исчезновению нескольких шпионов. Оставив детей в надежных руках, они отправляются распутывать дело. Когда дети узнают, чем на самом деле занимаются их родители, они решают стать шпионами и отправляются на их поиски.