Очень тяжело переживают смерть матери и жены герои фильма «Пеликан» Янис и его отец. Жизнь на крошечном греческом острове не богата событиями, работы мало, жить почти не на что. Да еще и отец так погрузился в мысли о потерянной жене и отрешился от мира, что мальчику самому приходится заботиться об их пропитании, продавая козий сыр. Но много ли выручишь за это?
Однажды мальчику на глаза попадается птенец, такой изможденный и жалкий с виду, что никто бы не дал гроша ломаного за его жизнь. Но Янис во внезапном порыве выкупает малыша у купцов и берется за его воспитание. Когда отец узнает, что его сын выменял последнюю вещь, связанную с памятью матери (золотой крестик) на бесполезную с его точки зрения птицу, он совсем уходит в себя и перестает общаться с мальчиком.
Время, которое, казалось бы, должно лечить все раны, не может справиться с горем отца. Но оно идет своим чередом. Птенец быстро растет и превращается в красавца пеликана, очень привязанного к своему другу Янису. Необычная птица на маленьком островке привлекает туда поток туристов, которые непременно хотят сфотографироваться вместе с пеликаном. Появились деньги, жизнь немного налаживается. Но отношения с отцом по-прежнему остаются натянутыми. Но однажды несчастье, произошедшее с пеликаном, переворачивает что-то в душе убитого горем мужчины. Втайне от сына он выхаживает раненую птицу, возвращая ее к жизни, одновременно возвращаясь к жизни и сам.