События фантастической кинокартины «Время ведьм» происходят в средневековой Европе. Четырнадцатый век, окрашенный в истории в темные тона, прежде всего, запомнился чумой, унесшей жизни тысяч людей. Кроме того, это время истребления ведьм, считавшихся причиной вселенского зла и многочисленных напастей. В это время девушку, оклеветанную или уличенную в колдовстве, беспощадно терроризировали и уничтожали, даже не позаботившись о фактах, доказательствах, подтверждающих ее виновность.
Но сюжет фильма несколько иначе обыгрывает предания о ведьмах и сатане. Крестоносцы Фелсон и Бэймен возвращаются в Европу, население которой сокращается из-за чумы. Кардинал Д’Амбруз обвиняет их в дезертирстве, но обещает даровать прощение, если им удастся доставить крестьянку-ведьму, наславшую на Европу чуму, в монастырь, где монахи смогут снять ее чары и избавить человечество от чумы. Согласившись на требования кардинала, Бэймен и Фелсон отправляются в далекий и трудный путь. Поначалу крестоносцы считают, что девушку оклеветали, но чем дальше они в пути, тем меньше сомнений в истинности обвинений, выдвинутых в адрес девушки, у них остается. Мистические совпадения сопровождают их в пути, а конвоиры погибают один за другим.